A amniocentese consiste na recolha de uma pequena quantidade de liquido amniótico que rodeia o feto. O liquido amniótico 
tem células da pele do bebê, que ao serem analisadas podem mostrar alterações cromossômicas.
Este exame só pode ser realizado depois das 15 semanas. Antes dessa data pode provocar um aborto espontâneo.
Para realizar a amniocentese pode não ser necessária anestesia, pois a agulha usada é mais fina que na BVC. Consiste na introdução de uma agulha até ao útero, evitando o feto, e se possível, evitando também a placenta. Desta introdução recolhe-se uma amostra de liquido amniótico.
A amniocentese serve para detectar anomalias dos cromossomas, doenças genéticas e infecções fetais. Pode ser utilizada no final da gravidez para ver se os pulmões do bebê estão suficientemente maduros para poder respirar autonomamente.
Realizar este exame não é considerado doloroso, mas sim poderá ser desconfortável. No entanto, tem uma duração de apenas 10 minutos, o que se torna bastante tolerável.
O risco de o aborto espontâneo ocorrer é de 1% e acontece geralmente uma semana após a realização do exame.
